Zawodnik grający na pozycji obrotowego był wychowankiem KSSPR Końskie. Przed rozpoczęciem obecnych rozgrywek przeszedł do występującego w PGNiG Superlidze Piotrkowianina Piotrków Trybunalski. W barwach tego klubu po raz ostatni zagrał 23 lutego. Piotrkowianin mierzył się wówczas z mistrzem Polski, PGE Vive Kielce. Jakubowski uważany był za jeden z większych talentów polskiego szczypiorniaka.
Był regularnie powoływany do młodzieżowych reprezentacji Polski. W 2018 roku był uczestnikiem mistrzostw Europy juniorów. Do tragicznej śmierci Jakubowskiego doszło w nocy z soboty na niedzielę w miejscowości Jacentów w województwie świętokrzyskim. Samochód prowadzony przez szczypiornistę z niewyjaśnionych przyczyn zjechał z drogi, dachował i wpadł do rzeki Czarna.
Jakubowski zginął na miejscu. O siódmej rano auto w rzece dostrzegł rowerzysta, który wezwał służby ratunkowe. Po szczegółowych poszukiwaniach ustalono, że z 18-latkiem nikt nie podróżował. - Nie żyje nasz obrotowy Dawid Jakubowski. Zginął w niedzielę rano w miejscowości Jacentów w gminie Radoszyce. Dawid jechał swoim volkswagenem i jak wynika z ustaleń policyjnych wypadł z drogi, dachował i wpadł do rzeki Czarnej. Niestety nie zdołał się uratować - czytamy w komunikacie klubu.