Avdukić większość swojej kariery spędził w bośniackich klubach, choć ma także na koncie występy w chorwackiej ekstraklasie, z drużyną NK Kamen Ingrad Velika. Od 2010 roku mierzący 190 centymetrów bramkarz jest piłkarzem klubu FC Borac Banja Luka.
Przeczytaj koniecznie: Ekstraklasa. Michaił Siwakow będzie rządził Wisłą Kraków
Zawodnik był reprezentantem Bośni i Hercegowiny do lat 19 i 21. 10 grudnia ubiegłego roku zadebiutował w kadrze seniorskiej, w meczu przeciwko... Polsce (2:2) - po przerwie wchodząc z ławki rezerwowych.
Asmir Avdukić został nominowany do nagrody dla najlepszego bramkarza Bośni i Hercegowiny 2010 roku.