W pierwszej rundzie biorą udział zwycięzcy rundy wstępnej oraz 18 zespołów występujących w I lidze w zeszłym sezonie. Zespoły rozgrywają jeden mecz.
I runda:
Limanovia Szubryt Limanowa - Piast Gliwice
Wigry Suwałki - Termalica Nieciecza
Luboński KS - GKS Gieksa Katowice
Sokół Ostróda - Ruch Radzionków
Pelikan Łowicz - Kolejarz Stróże
Okocimski Brzesko - Polonia Bytom
Miedź Legnica - Dolcan Ząbki
Łysica II Bodzentyn - Wisła Płock
Kotwica Kołobrzeg - Warta Poznań
Ruch Zdzieszowice - Flota Świnoujście
Górnik Wałbrzych - Sandencja Nowy Sącz
Sokół Aleksandrów Łódzki - Zawisza Bydgoszcz
Legia Warszawa (Młoda Ekstraklasa) - KS Polkowice
Stomil Olsztyn - Bogdanka Łęczna
Olimpia Grudziądz - Pogoń Szczecin
Arka Gdynia - Olimpia Elbląg
W 1/16 finału biorą udział zwycięzcy meczów rundy pierwszej oraz 16 zespołów występujących w ekstraklasie w sezonie 2011/2012. Zespoły rozgrywają jeden mecz.
1/16 finału:
Limanovia Szubryt Limanowa/Piast Gliwice - Widzew Łódź
Wigry Suwałki/Termalica Nieciecza - GKS Bełchatów
Luboński KS/GKS Gieksa Katowice - Wisła Kraków
Sokół Ostróda/Ruch Radzionków - Jagiellonia Białystok
Pelikan Łowicz/Kolejarz Stróże - Ruch Chorzów
Okocimski KS Brzesko/Polonia Bytom - Legia Warszawa
Miedź Legnica/Dolcan Ząbki - Polonia Warszawa
Łysica II Bodzentyn/Wisła Płock - Zagłębie Lubin
Kotwica Kołobrzeg/Warta Poznań - Podbeskidzie Bielsko-Biała
Ruch Zdzieszowice/Flota Świnoujście - Górnik Zabrze
Górnik Wałbrzych/Sandencja Nowy Sącz - ŁKS Łódź
Sokół Aleksandrów Łódzki/Zawisza Bydgoszcz - Cracovia
Legia Warszawa (ME)/KS Polkowice - Śląsk Wrocław
Stomil Olsztyn/GKS Bogandak Łęczna - Lechia Gdańsk
Olimpia Grudziądz/Pogoń Szczecin - Lech Poznań
Arka Gdynia/Olimpia Elbląg - Korona Kielce