Ostatni raz zagrał 5 lipca w ćwierćfinale Euro 2024, przegranym z Hiszpanią 1:2.
"W pewnym momencie musiał nadejść ten dzień. Moja kariera w reprezentacji Niemiec dobiegła końca. Każdy kto mnie zna, wie że była to dla mnie trudna decyzja" – napisał Neuer na Instagramie.
Zadebiutował w seniorskiej kadrze 2 czerwca 2009 roku w wygranym 7:2 meczu towarzyskim ze Zjednoczonymi Emiratami Arabskimi i szybko stał się pierwszoplanową postacią drużyny trenera Joachima Loewa.
Doszedł z reprezentacją do półfinału mistrzostw świata w RPA i zdobył brązowy medal po zwycięstwie nad Urugwajem 3:2. Następnie dotarł do półfinału Euro 2012. Niemcy na Stadionie Narodowym w Warszawie ulegli Włochom 0:2 po dwóch golach Mario Balotellego. Dwa lata później reprezentacja Niemiec wygrała 1:0 z Argentyną w finale mundialu w Brazylii, a zwycięską bramkę w dogrywce zdobył Mario Goetze. W półfinale Euro 2016 Niemcy ulegli Francji 0:2. W kolejnych turniejach drużyna Neuera nie odnosiła większych sukcesów.
W grudniu 2022 roku Neuer złamał kość podudzia podczas jazdy na nartach. Po żmudnej rehabilitacji wrócił do gry w październiku 2023 roku i szybko odzyskał status pierwszego bramkarza Bayernu Monachium i reprezentacji. Selekcjoner Julian Nagelsmann postawił na niego podczas tegorocznych mistrzostw Europy, które odbywały się w Niemczech.
Gospodarzami mundialu w 2026 roku będą Kanada, USA i Meksyk. Neuer będzie miał wówczas 40 lat. Teraz podstawowym bramkarzem reprezentacji Niemiec będzie najprawdopodobniej 32-letni Marc Andre ter Stegen z Barcelony.
Po Euro 2024 występy w reprezentacji Niemiec zakończyli także Toni Kroos i Thomas Mueller, którzy wraz z Neuerem byli ostatnimi przedstawicielami mistrzów świata z 2014 roku. Kroos definitywnie pożegnał się z futbolem, natomiast Mueller i Neuer wciąż grają w Bayernie Monachium.